CDKN2A（P16）/CDKN2B（P15）の変化とホモ接合染色体腕の関連性の関連性肺癌における9p欠失

染色体ARM 9Pで複数の腫瘍抑制遺伝子の存在の可能性を解明するために、CDKN2A/P16/MTS1およびCDKN2B/P15/MTS2遺伝子の遺伝的およびエピジェネティックな分析を実施し、ヒトLUNG癌における9Pのホモ接合体欠失マッピングを行いました。非癌細胞の汚染による遺伝的変化を見落とすために、32の非小細胞肺癌（NSCLC）および16細胞小細胞肺癌（SCLC）細胞株を調べました。（CDKN2Aは32 NSCLC細胞株の20（63％）で突然変異またはホモ接合により削除され、CDKN2A遺伝子のCPG島のメチル化は、野生型CDKN2A遺伝子を運ぶ12の細胞株のうち6つで検出されました。ただしCDKN2B遺伝子は、CdKN2Aの欠失、変異、およびCdKN2B遺伝子のメチル化を伴うNSCLC細胞株でも検出されたため、CDKN2B遺伝子ではなくCdKN2A遺伝子がNSCLCの腫瘍抑制遺伝子として重要な役割を果たすことが示されました。9pのホモ接合削除は、14（44％）NSCLC細胞株で検出されました。ホモ接合削除の2つの一般的な領域がCdKN2AおよびCDKN2B遺伝子座の近位でマッピングされ、CDKN2A以外の腫瘍抑制遺伝子が9Pに存在することを示唆しています。NSCLCとは対照的に、9Pのホモ接合の欠失、およびCDKN2AおよびCDKN2Bの変化はSCLCではまれでした。したがって、9P変化の病原性の有意性はSCLCとNSCLCの間で異なる可能性があります。

To elucidate the possibility of the existence of multiple tumor suppressor genes on chromosome arm 9p, we performed genetic and epigenetic analyses of the CDKN2A/p16/MTS1 and CDKN2B/p15/MTS2 genes as well as homozygous deletion mapping of 9p in human lung carcinoma. To avoid overlooking genetic alterations due to contamination of noncancerous cells, we examined 32 non-small cell lung carcinoma (NSCLC) and 16 cell small cell lung carcinoma (SCLC) cell lines. (CDKN2A was mutated or homozygously deleted in 20 (63%) of 32 NSCLC cell lines, and methylation of the CpG island in the CDKN2A gene was detected in six of the 12 cell lines carrying the wild-type CDKN2A gene. Although homozygous deletions of the CDKN2B gene were also detected in NSCLC cell lines with CDKN2A deletions, mutation and methylation in the CDKN2B gene were infrequent. Thus, it was indicated that the CDKN2A gene rather than the CDKN2B gene plays a critical role as a tumor suppressor gene in NSCLC. Homozygous deletions on 9p were detected in 14 (44%) NSCLC cell lines. It is of note that two common regions of homozygous deletions were mapped proximal to the CDKN2A and CDKN2B loci, suggesting that tumor suppressor genes other than CDKN2A are present on 9p. In contrast to NSCLC, homozygous deletions on 9p as well as CDKN2A and CDKN2B alterations were infrequent in SCLC. Therefore, the pathogenetic significance of 9p alterations is likely to differ between SCLC and NSCLC.