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ポリプリン路(PPT)のすぐ上流の短いTリッチ配列は、ヒトおよびSymian免疫不全ウイルス(HIVおよびSIV)のプロビル性ゲノムで高度に保存されています。この「Uボックス」がSIVMAC239の複製に影響するかどうかを調査するために、ウイルスゲノムのこの領域の変化を伴う変異体の特性を分析しました。すべての変異体は、成長(最大1か月の遅延)で遅れているか、CEMX174細胞では検出可能に複製されませんでした。U-Box変異体が検出可能に複製した場合、ウイルスゲノムでは補償変化が一貫して観察されました。最も一般的な代償的変化は、PPTのすぐ上流のチミジンの獲得でしたが、PPTの長さの顕著な拡大も観察されました。トランスフェクションによって一時的に生成されたU-box変異体は、感染性アッセイで逆転写産物を生成する能力が重度に損なわれました。一時的に産生された変異ウイルスの分析により、RNAパッケージングやウイルスアセンブリに欠陥がないことが明らかになりました。これらの結果は、逆転写を含むウイルスのライフサイクルの初期のステップに重要な新しい構造要素を特定します。
ポリプリン路(PPT)のすぐ上流の短いTリッチ配列は、ヒトおよびSymian免疫不全ウイルス(HIVおよびSIV)のプロビル性ゲノムで高度に保存されています。この「Uボックス」がSIVMAC239の複製に影響するかどうかを調査するために、ウイルスゲノムのこの領域の変化を伴う変異体の特性を分析しました。すべての変異体は、成長(最大1か月の遅延)で遅れているか、CEMX174細胞では検出可能に複製されませんでした。U-Box変異体が検出可能に複製した場合、ウイルスゲノムでは補償変化が一貫して観察されました。最も一般的な代償的変化は、PPTのすぐ上流のチミジンの獲得でしたが、PPTの長さの顕著な拡大も観察されました。トランスフェクションによって一時的に生成されたU-box変異体は、感染性アッセイで逆転写産物を生成する能力が重度に損なわれました。一時的に産生された変異ウイルスの分析により、RNAパッケージングやウイルスアセンブリに欠陥がないことが明らかになりました。これらの結果は、逆転写を含むウイルスのライフサイクルの初期のステップに重要な新しい構造要素を特定します。
A short stretch of T-rich sequences immediately upstream of the polypurine tract (PPT) is highly conserved in the proviral genomes of human and simian immunodeficiency viruses (HIV and SIV). To investigate whether this 'U-box' influences SIVmac239 replication, we analyzed the properties of mutants with changes in this region of the viral genome. All mutants were either retarded in their growth (up to one month delay) or did not replicate detectably in CEMx174 cells. When U-box mutants did replicate detectably, compensatory changes were consistently observed in the viral genome. The most common compensatory change was the acquisition of thymidines immediately upstream of the PPT, but marked expansion in the length of the PPT was also observed. U-box mutants produced transiently by transfection were severely impaired in their ability to produce reverse transcripts in infectivity assays. Analysis of transiently produced mutant virus revealed no defect in RNA packaging or virus assembly. These results identify a new structural element important for an early step in the viral life cycle that includes reverse transcription.
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