神間Zymesと複製：生物学的触媒の理論モデル

神間は、官能基による遷移状態の安定化に最適なジオメトリを計算することによって構築された理論的酵素です。触媒機能の定量的評価を可能にするために作成されます。神間は、酵素および抗体触媒のあるヒドロキシエポキシド循環、除去および脱炭酸、ペプチドおよびエステル加水分解物、および環状およびラジカルな反応の根底にあるメカニズムにおける遷移状態の安定化の役割を解明するために使用されてきました。研究された酵素には、オロトジンモノリン酸デカルボキシラーゼ、HIVプロテアーゼ、リボヌクレオチド還元酵素が含まれます。

A theozyme is a theoretical enzyme constructed by computing the optimal geometry for transition-state stabilization by functional groups. It is created in order to permit quantitative assessment of catalytic function. Theozymes have been used to elucidate the role of transition-state stabilization in the mechanisms underlying enzyme- and antibody-catalyzed hydroxyepoxide cyclizations, eliminations and decarboxylations, peptide and ester hydrolyses, and pericyclic and radical reactions. The enzymes studied include orotodine monophosphate decarboxylase, HIV protease and ribonucleotide reductase.