チンパンジーパントログロジテストログロジテスのHIV-1の起源

ヒトAIDSウイルスヒト免疫不全ウイルス1型（HIV-1）および2型（HIV-2）は、異種（動物骨）感染を表しています。HIV-2の霊長類の貯留層は、すごいマンガベイ（Cercocebus atys）として明確に特定されていますが、HIV-1の起源は不明のままです。HIV-1に関連するウイルスは、一般的なチンパンジー（PAN Troglodytes）から分離されていますが、そのようなSIVCPZ感染症は3つしか記録されていません。その1つは、異なる霊長類の系統系を表す可能性のある非常に多様なウイルスを含んでいます。HIV-1貯水池の検索で、新しいSIVCPZSTRAIN（SIVCPZUS）のゲノムを配列決定し、ミトコンドリアDNA分析により、既知のすべてのSIVCPZ感染チンパンゼの亜種同一性を決定しました。アフリカの2つのチンパンジー亜種、中央P. t。Troglodytesと東部P. t。Schweinfurthii、Harbor Sivcpz、およびそれぞれのウイルスが2つの非常に多様な（ただし亜種固有の）系統発生系統を形成すること。HIV-1グループM、N、およびOを含む人間に感染することが知られているすべてのHIV-1株は、P。tで見つかったこれらのSIVCPZ系統の1つだけに密接に関連しています。Troglodytes。さらに、HIV-1グループNはSivcpzusおよびHIV-1関連のシーケンスのモザイクであり、チンパンジーの宿主における先祖の組換えイベントを示していることがわかります。これらの結果は、P。tの天然範囲であるという観察とともに。Troglodytesは、HIV-1グループM、N、Oの固有性の領域と一意に一致し、P。t。TroglodytesはHIV-1の主要な貯水池であり、SIVCPZの少なくとも3つの独立した導入の源泉です。

The human AIDS viruses human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1) and type 2 (HIV-2) represent cross-species (zoonotic) infections. Although the primate reservoir of HIV-2 has been clearly identified as the sooty mangabey (Cercocebus atys), the origin of HIV-1 remains uncertain. Viruses related to HIV-1 have been isolated from the common chimpanzee (Pan troglodytes), but only three such SIVcpz infections have been documented, one of which involved a virus so divergent that it might represent a different primate lentiviral lineage. In a search for the HIV-1 reservoir, we have now sequenced the genome of a new SIVcpzstrain (SIVcpzUS) and have determined, by mitochondrial DNA analysis, the subspecies identity of all known SIVcpz-infected chimpanzees. We find that two chimpanzee subspecies in Africa, the central P. t. troglodytes and the eastern P. t. schweinfurthii, harbour SIVcpz and that their respective viruses form two highly divergent (but subspecies-specific) phylogenetic lineages. All HIV-1 strains known to infect man, including HIV-1 groups M, N and O, are closely related to just one of these SIVcpz lineages, that found in P. t. troglodytes. Moreover, we find that HIV-1 group N is a mosaic of SIVcpzUS- and HIV-1-related sequences, indicating an ancestral recombination event in a chimpanzee host. These results, together with the observation that the natural range of P. t. troglodytes coincides uniquely with areas of HIV-1 group M, N and O endemicity, indicate that P. t. troglodytes is the primary reservoir for HIV-1 and has been the source of at least three independent introductions of SIVcpz into the human population.